(1) აღჭურვილობის შერჩევა.არსებობს ფარმაცევტული აღჭურვილობის შერჩევისას გარკვეული პრობლემები, როგორიცაა გამოცდილებით შერჩევა (ფაქტობრივი გაანგარიშების გარეშე, ან არასაკმარისი მონაცემების გაანგარიშების გარეშე), წინსვლის ბრმა სწრაფვა და ფიზიკური მონაცემების არასაკმარისი გამოკვლევა, რაც სერიოზულად მოქმედებს აღჭურვილობის პრაქტიკულობასა და ეკონომიურობაზე.

(2) აღჭურვილობის მონტაჟი და სწავლება.ფარმაცევტული აღჭურვილობის დამონტაჟების პროცესში ხშირად ექცევა ყურადღება სამშენებლო პროგრესს, იგნორირებას უკეთებს მშენებლობის ხარისხს, რაც იწვევს შემდგომ პერიოდში აღჭურვილობის შენარჩუნების ხარჯების ზრდას.გარდა ამისა, აღჭურვილობის მოვლისა და ექსპლუატაციის პერსონალის არაადეკვატური ტრენინგი ასევე უქმნის რისკებს ფარმაცევტული აღჭურვილობის მენეჯმენტისა და ტექნიკური მომსახურებისთვის.

(3) არასაკმარისი ინვესტიცია ინფორმატიზაციის მართვასა და შენარჩუნებაში.დღესდღეობით, მიუხედავად იმისა, რომ ბევრი საწარმო დიდ მნიშვნელობას ანიჭებს აღჭურვილობის მენეჯმენტსა და შენარჩუნებას, ასევე აღჭურვილობის ტექნიკური ჩანაწერების მართვას და ძირითადი პარამეტრების აღრიცხვას და შესრულებულს, მაგრამ გარკვეული პრობლემები მაინც არსებობს, როგორიცაა ძნელია გაგრძელების ტექნიკური მონაცემების მიწოდება, ეფექტური არარსებობა. ფარმაცევტული აღჭურვილობის სპეციფიკაციის ინფორმაცია, როგორიცაა სპეციფიკაციები, ნახატები და ა.შ., ამ უხილავმა გაზარდა აღჭურვილობის მართვის, ტექნიკური და რეკონსტრუქციის სირთულე.

(4) მართვის სისტემა.ეფექტური მართვის სისტემისა და მეთოდების ნაკლებობა, რის შედეგადაც ფარმაცევტული აღჭურვილობის ტექნიკური პერსონალის მენეჯმენტი არასაკმარისია, ტექნიკური პერსონალის მუშაობა სტანდარტიზაციის ნაკლებობა, ფარმაცევტული აღჭურვილობის მენეჯმენტი და ტექნიკური პროცესი ტოვებს უსაფრთხოებას ფარულ საფრთხეებს.